Il film narra le vicende di Peter Parker, studente di liceo emarginato, abbandonato dai genitori quando era solo un bambino e affidato agli zii. Come tutti i ragazzi, vuole capire chi è davvero e cosa lo ha portato ad essere ciò che è oggi. Sta inoltre scoprendo per la prima volta l'amore insieme alla sua ragazza, Gwen Stacy. Un giorno, inavvertitamente, entra in possesso di alcuni documenti in merito alla sparizione dei suoi genitori. Deciso a scoprire la verità, Peter scoprirà che tutte le tracce portano in un'unica direzione: i laboratori della Oscorp.